MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 67368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007795	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007795	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007795	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007795	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007795	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007795	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007795	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007795	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007795	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007795	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193824
12	NC_007795	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193824
13	NC_007795	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193824
14	NC_007795	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193824
15	NC_007795	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
16	NC_007795	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193824
17	NC_007795	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193824
18	NC_007795	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193824
19	NC_007795	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	88193824
20	NC_007795	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193824
21	NC_007795	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	88193824
22	NC_007795	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193824
23	NC_007795	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193824
24	NC_007795	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193824
25	NC_007795	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193824
26	NC_007795	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193824
27	NC_007795	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
28	NC_007795	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88193824
29	NC_007795	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
30	NC_007795	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193824
31	NC_007795	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88193824
32	NC_007795	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
33	NC_007795	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
34	NC_007795	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88193824
35	NC_007795	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	88193824
36	NC_007795	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	88193824
37	NC_007795	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193824
38	NC_007795	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193824
39	NC_007795	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	88193824
40	NC_007795	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	88193824
41	NC_007795	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	88193824
42	NC_007795	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
43	NC_007795	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193824
44	NC_007795	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	88193824
45	NC_007795	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	88193824
46	NC_007795	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
47	NC_007795	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193824
48	NC_007795	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007795	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007795	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007795	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007795	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007795	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007795	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007795	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	88193825
56	NC_007795	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
57	NC_007795	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
58	NC_007795	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193825
59	NC_007795	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193825
60	NC_007795	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193825
61	NC_007795	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	88193825
62	NC_007795	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	88193825
63	NC_007795	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	88193825
64	NC_007795	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
65	NC_007795	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	88193825
66	NC_007795	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	88193825
67	NC_007795	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	88193825
68	NC_007795	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193825
69	NC_007795	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193825
70	NC_007795	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	88193825
71	NC_007795	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193825
72	NC_007795	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88193825
73	NC_007795	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	88193825
74	NC_007795	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
75	NC_007795	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193825
76	NC_007795	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	88193825
77	NC_007795	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
78	NC_007795	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193825
79	NC_007795	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193825
80	NC_007795	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193825
81	NC_007795	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193825
82	NC_007795	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88193825
83	NC_007795	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193825
84	NC_007795	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193825
85	NC_007795	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	88193825
86	NC_007795	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	88193825
87	NC_007795	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	88193825
88	NC_007795	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193825
89	NC_007795	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193825
90	NC_007795	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88193825
91	NC_007795	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193825
92	NC_007795	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	88193825
93	NC_007795	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007795	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007795	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007795	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007795	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007795	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007795	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007795	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007795	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007795	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007795	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007795	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007795	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193826
106	NC_007795	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193826
107	NC_007795	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193826
108	NC_007795	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193826
109	NC_007795	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193826
110	NC_007795	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	88193826
111	NC_007795	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	88193826
112	NC_007795	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	88193826
113	NC_007795	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193827
114	NC_007795	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	88193827
115	NC_007795	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193827
116	NC_007795	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	88193827
117	NC_007795	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193827
118	NC_007795	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88193827
119	NC_007795	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193827
120	NC_007795	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193827
121	NC_007795	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193827
122	NC_007795	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	88193827
123	NC_007795	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193827
124	NC_007795	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193827
125	NC_007795	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193827
126	NC_007795	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193827
127	NC_007795	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193827
128	NC_007795	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193827
129	NC_007795	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193827
130	NC_007795	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193827
131	NC_007795	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193827
132	NC_007795	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193828
133	NC_007795	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	88193828
134	NC_007795	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	88193828
135	NC_007795	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193828
136	NC_007795	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	88193828
137	NC_007795	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193828
138	NC_007795	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	88193828
139	NC_007795	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193828
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141	NC_007795	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193828
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